Pada tahun 2024, di Provinsi Kalimantan Utara, lomba Festival Lomba Seni Siswa Nasional (FLS2N) digelar mulai tanggal 26 hingga 28 Mei. Kegiatan ini melibatkan semua Sekolah Menengah Atas (SMA) dari berbagai kabupaten di provinsi tersebut, yang turut serta dalam berbagai cabang lomba. Dalam edisi ini, SMA Negeri 3 Nunukan menjadi perwakilan dalam cabang lomba tari kreasi dan fotografi. Dari kedua cabang lomba tersebut, prestasi tertinggi diraih dalam cabang fotografi, di mana SMA Negeri 3 Nunukan berhasil meraih juara 3 tingkat provinsi. Namun, demikian, cabang lomba tari kreasi belum berhasil meraih juara pada FLS2N tahun ini. Kegiatan FLS2N ini merupakan agenda rutin yang diadakan setiap tahun di tingkat SMA, memberikan kesempatan bagi para siswa untuk mengeksplorasi bakat seni dan budaya mereka. Pemenang juara 1 di tingkat provinsi berhak melanjutkan kompetisi ke tingkat nasional dan mewakili Provinsi Kalimantan Utara dalam cabang lomba yang mereka ikuti.